Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXLO00592 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXLO00592 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXLO00592 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXLO00592 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXLO00592 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXLO00592 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXLO00592 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXLO00592 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXLO00592 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXLO00592 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXLO00592 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXLO00592 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXLO00592 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXLO00592 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXLO00592 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXLO00592 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXLO00592 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXLO00592 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXLO00592 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXLO00592 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXLO00592 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXLO00592 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXLO00592 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXLO00592 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXLO00592 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXLO00592 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXLO00592 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXLO00592 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PODXLO00592 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXLO00592 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXLO00592 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXLO00592 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXLO00592 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PODXLO00592 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PODXLO00592 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PODXLO00592 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PODXLO00592 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXLO00592 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXLO00592 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXLO00592 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXLO00592 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PODXLO00592 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXLO00592 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXLO00592 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXLO00592 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXLO00592 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXLO00592 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXLO00592 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PODXLO00592 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXLO00592 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXLO00592 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXLO00592 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXLO00592 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PODXLO00592 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PODXLO00592 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PODXLO00592 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PODXLO00592 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PODXLO00592 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PODXLO00592 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PODXLO00592 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PODXLO00592 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PODXLO00592 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PODXLO00592 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PODXLO00592 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PODXLO00592 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PODXLO00592 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PODXLO00592 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PODXLO00592 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PODXLO00592 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms