Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KPNA3O00505 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms