Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QR89 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QR89 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QR89 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QR89 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QR89 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QR89 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QR89 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QR89 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QR89 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QR89 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QR89 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QR89 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QR89 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QR89 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QR89 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QR89 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QR89 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QR89 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QR89 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QR89 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QR89 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QR89 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QR89 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QR89 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QR89 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QR89 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QR89 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QR89 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QR89 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QR89 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QR89 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QR89 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QR89 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3QR89 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms