Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DXG7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DXG7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DXG7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DXG7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DXG7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DXG7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DXG7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DXG7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DXG7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DXG7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DXG7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DXG7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DXG7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DXG7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DXG7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DXG7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DXG7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DXG7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DXG7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DXG7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DXG7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DXG7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DXG7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DXG7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DXG7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DXG7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DXG7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DXG7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DXG7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DXG7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DXG7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DXG7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DXG7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DXG7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DXG7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
B4DXG7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DXG7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DXG7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DXG7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DXG7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DXG7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DXG7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DXG7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DXG7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DXG7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DXG7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DXG7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DXG7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DXG7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DXG7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DXG7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DXG7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DXG7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DXG7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DXG7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DXG7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DXG7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DXG7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DXG7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DXG7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DXG7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DXG7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DXG7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DXG7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DXG7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DXG7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.3 ms