Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOBPA7XYQ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOBPA7XYQ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOBPA7XYQ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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