Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC154A6NI56 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC154A6NI56 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.8 ms