Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT1A5YKK6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms