Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPED1A4D0V7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPED1A4D0V7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms