Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SSPOA2VEC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SSPOA2VEC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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