Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRGMA1A4Y4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRGMA1A4Y4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms