Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAARA0A1B0GVQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAARA0A1B0GVQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.1 ms