Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms