Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms