Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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