Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms