Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms