Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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