Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms