Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms