Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSPNQ9HAW4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms