Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms