Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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COL25A1Q9BXS0 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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COL25A1Q9BXS0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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COL25A1Q9BXS0 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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COL25A1Q9BXS0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL25A1Q9BXS0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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