Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BBS2Q9BXC9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms