Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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