Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM208Q9BTX3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms