Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms