Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms