Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA7

TONSL, Tonsoku-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TONSLQ96HA7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TONSLQ96HA7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TONSLQ96HA7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms