Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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