Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM41Q8WV44 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms