Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF4Q8WV16 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms