Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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