Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS8Q8N3P4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms