Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACS2Q86VP3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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