Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D4Q7Z3S7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms