Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP34Q70CQ2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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