Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TPTE2Q6XPS3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TPTE2Q6XPS3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms