Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf89Q6UX73 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms