Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms