Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MED27Q6P2C8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MED27Q6P2C8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MED27Q6P2C8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MED27Q6P2C8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MED27Q6P2C8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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MED27Q6P2C8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms