Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KHDC1Q4VXA5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.9 ms