Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms