Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms