Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM187BQ17R55 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM187BQ17R55 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM187BQ17R55 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM187BQ17R55 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM187BQ17R55 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM187BQ17R55 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM187BQ17R55 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM187BQ17R55 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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