Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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