Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMA3Q16787 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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