Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NRF1Q16656 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NRF1Q16656 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NRF1Q16656 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NRF1Q16656 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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NRF1Q16656 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NRF1Q16656 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NRF1Q16656 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NRF1Q16656 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NRF1Q16656 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRF1Q16656 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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