Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RPE65Q16518 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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