Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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