Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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